.cram Расширение файла
Тип файлаCompressed Alignment File
Разработчик | EBI |
Категория | Дата файлы |
Формат | Binary |
.CRAM вариант №
Формат сжатого формата выравнивания, разработанный EBI, удаленной станцией Европейской лаборатории молекулярной биологии; хранит короткие последовательности считывания последовательности ДНК, созданные из коротких считывающих выравнивателей, таких как BWA, BBMap и BLAT.
Формат файла CRAM похож на формат файла Binary Alignment / Map (BAM), но обладает улучшенным сжатием файлов и реструктурированным форматом двоичного контейнера, ориентированным на столбцы. По мере увеличения объемов данных в области генетического программного обеспечения формат CRAM был разработан с целью уменьшения отпечатков пальцев для выравнивания диска.
Короткое чтение выравнивания - это процесс расшифровки, в котором происходит последовательность из генома. Это может быть сложно, поскольку ссылочный геном довольно большой, и вы не всегда ищете точные соответствия в эталонном геноме. Короткие считывающие устройства используются для поиска огромных последовательностей для совпадений и ближних матчей. Поскольку последовательности настолько велики, сжатие, обеспечиваемое форматами, такими как CRAM, необходимо для того, чтобы поддерживать допустимые размеры файлов. Р>
Windows |
|