Главная : Расширения файлов : .cram File

.cram Расширение файла

Тип файлаCompressed Alignment File

Разработчик EBI
Категория Дата файлы
Формат Binary

.CRAM вариант №

Формат сжатого формата выравнивания, разработанный EBI, удаленной станцией Европейской лаборатории молекулярной биологии; хранит короткие последовательности считывания последовательности ДНК, созданные из коротких считывающих выравнивателей, таких как BWA, BBMap и BLAT.

Больше информации

Формат файла CRAM похож на формат файла Binary Alignment / Map (BAM), но обладает улучшенным сжатием файлов и реструктурированным форматом двоичного контейнера, ориентированным на столбцы. По мере увеличения объемов данных в области генетического программного обеспечения формат CRAM был разработан с целью уменьшения отпечатков пальцев для выравнивания диска.

Короткое чтение выравнивания - это процесс расшифровки, в котором происходит последовательность из генома. Это может быть сложно, поскольку ссылочный геном довольно большой, и вы не всегда ищете точные соответствия в эталонном геноме. Короткие считывающие устройства используются для поиска огромных последовательностей для совпадений и ближних матчей. Поскольку последовательности настолько велики, сжатие, обеспечиваемое форматами, такими как CRAM, необходимо для того, чтобы поддерживать допустимые размеры файлов.

Программы, которые открывают CRAM файлы
Windows
Samtools

О CRAM файлах

Наша цель - помочь вам понять за что отвечает файл с расширением * .cram и как его открыть.

Тип файла Compressed Alignment File, описания программ для Mac, Windows, Linux, Android и iOS, перечисленные на этой странице, были индивидуально исследованы и проверены командой FileExt. Мы стремимся к 100-процентной точности и публикуем только информацию о форматах файлов, которые мы тестировали и проверяли.