Файл PDB (что это такое и как его открыть)

Файл с расширением PDB, скорее всего, является файлом базы данных программ, который используется для хранения отладочной информации о программе или модуле, например, файл DLL или EXE. Иногда их называют файлами символов.

Этот файл сопоставляет различные компоненты и операторы в исходном коде со своим финальным скомпилированным продуктом, который затем может использовать отладчик для поиска исходного файла и места в исполняемом файле, в котором он должен остановить процесс отладки.

Некоторые файлы PDB вместо этого могут быть в формате файла Protein Data Bank. Это простые текстовые файлы, в которых хранятся координаты белковых структур.

Другие файлы PDB, вероятно, создаются в формате файлов Palm Database или PalmDOC и используются с мобильной операционной системой PalmOS; некоторые файлы в этом формате вместо этого используют расширение .PRC. Еще один возможный формат — Tanida Demo Builder.

Как открыть файл PDB

Различные программы используют свой собственный файл PDB для хранения данных в каком-то структурированном формате базы данных, поэтому каждое приложение используется для открытия своего собственного типа.

Geneious, Quicken, Visual Studio и Pegasus — это лишь несколько примеров программ, которые могут использовать файл PDB в качестве файла базы данных. Radare и PDBparse также могут работать.

Некоторые файлы PDB хранятся в виде обычного текста, как файлы Geneious Program Debug Database, и полностью читаются человеком, если открыты в текстовом редакторе. Вы можете открыть этот тип PDB-файла с помощью любой программы, которая может читать текстовые документы, например, встроенной программы «Блокнот» в Windows. Некоторые другие средства просмотра и редакторы файлов PDB включают Notepad ++ и Brackets.

Другие файлы PDB не являются текстовыми документами и полезны только при открытии с помощью программы, для которой они предназначены. Например, если ваш каким-то образом связан с Quicken, попробуйте использовать это программное обеспечение для просмотра или редактирования. Visual Studio ожидает увидеть файл PDB в той же папке, что и файл DLL или EXE.

Вы можете просматривать и редактировать файлы PDB, которые являются файлами банка данных Protein, в Windows, Linux и macOS с помощью Avogadro. Эти программы также могут открывать файл: Jmol, RasMol, QuickPDB и USCF Chimera. Поскольку это обычный текст, вы также можете открыть его в текстовом редакторе.

Palm Desktop должен иметь возможность открывать этот файл, если он имеет формат файла базы данных Palm, но вам, возможно, придется сначала переименовать его, чтобы программа могла его распознать с расширением .PRC. Калибр — еще один вариант.

Чтобы открыть файл PalmDOC PDB, попробуйте STDU Viewer.

Файлы Tanida Demo Builder открываются программой с тем же именем.

Как конвертировать файл PDB

Файлы программной базы данных, скорее всего, невозможно преобразовать в другой формат файла, по крайней мере, с помощью обычного инструмента для преобразования файлов. Вместо этого, если есть какой-либо инструмент, который может преобразовать этот тип файла, это будет та же программа, которая может его открыть.

Например, если вам нужно преобразовать файл базы данных из Quicken, попробуйте использовать эту программу для этого. Однако этот тип преобразования, вероятно, не только малопригоден, но и не поддерживается в этих приложениях баз данных (т. Е. Вам, вероятно, не нужно преобразовывать этот тип файла PDB в какой-либо другой формат).

Файлы Protein Data Bank можно конвертировать в другие форматы с помощью MeshLab. Для этого вам может потребоваться сначала преобразовать его в WRL с помощью PyMOL из Отправьте > Сохранить изображение как > VRML меню, а затем импортируйте файл WRL в MeshLab и используйте Отправьте > Экспорт сетки как меню для окончательного преобразования файла PDB в STL или другой формат файла.

Если вам не нужно, чтобы модель была цветной, вы можете экспортировать файл непосредственно в STL с помощью USCF Chimera (ссылка для скачивания выше). В противном случае вы можете использовать тот же метод, что и выше (с MeshLab), для преобразования PDB в WRL с помощью USCF Chimera, а затем экспортировать WRL в STL с помощью MeshLab.

Преобразовать PDB в PDF или EPUB, если у вас есть файл PalmDOC, можно несколькими способами, но самый простой, вероятно, — использовать онлайн-конвертер, такой как Zamzar. Вы можете загрузить свой файл на этот веб-сайт, чтобы иметь возможность конвертировать его в эти форматы, а также в AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT и другие форматы файлов электронных книг.

Преобразовать файл PDB в формат FASTA можно с помощью онлайн-конвертера PDB в FASTA Meiler Lab.

Также возможно преобразовать этот файл в CIF (формат кристаллографической информации) онлайн с помощью PDBx / mmCIF.

По-прежнему не удается открыть файл?

Файлы, которые не открываются ни одним из перечисленных выше инструментов, вероятно, на самом деле не являются файлами PDB. Возможно, вы неправильно читаете расширение файла; в некоторых форматах используется суффикс, который очень похож на PDB, когда они действительно не связаны и работают по-разному.

Например, файл PDF — это файл документа, но большинство вышеперечисленных программ не будут правильно отображать текст и / или изображения, если вы попытаетесь открыть их с помощью этих программ. То же самое верно и для других файлов с аналогичными расширениями файлов, таких как файлы DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO и WPD.

PBD — это еще одна программа, которая принадлежит программе EaseUS Todo Backup и поэтому полезна только при открытии с помощью этого программного обеспечения.

Если у вас нет файла PDB, изучите расширение файла, которое имеет ваш файл, чтобы найти соответствующую программу, которая его открывает или преобразует.

Расширенное чтение файлов PDB

Вы можете узнать больше о файлах базы данных программ на GitHub и Wintellect.

Также можно узнать больше о файлах банка данных Protein; см. Worldwide Protein Data Bank и RCSB PDB.